دراسة: الطفرة العالمية لإنفلونزا الطيور شديدة الإمراض
أظهرت دراسة جديدة، أن الطفرة العالمية لإنفلونزا الطيور شديدة الإمراض، وكشف الباحثون عن الديناميكيات البيئية والفيروسية وراء النشاط العالمي المكثف لإنفلونزا الطيور شديدة الإمراض H5N1 منذ عام 2021، وفقًا لـ ميديكال إكسربس.
الطفرة العالمية لإنفلونزا الطيور شديد الإمراض
وأزال الباحثون التكرارات والسلالات المشتقة من المختبر والتسلسلات التي لا تحتوي على بيانات أو تغطية كافية، وصنفوا الجينومات المتبقية وفقًا لنظام تسمية H5N1 الذي حددته منظمة الصحة العالمية باستخدام LABEL v.0.6.3.
وقسم التحليل الفئة 2.3.4.4 إلى فئات فرعية بناءً على علاقاتها التطورية مع فيروسات اللقاح المرشح لمنظمة الصحة العالمية H5، باستخدام شجرة النشوء ذات الاحتمالية القصوى التي تم إنشاؤها باستخدامFastTree v.2.1.1
وتم تحديد المضيفين على أنهم إما طيور منزلية أو برية من خلال أسماء السلالات والبيانات الوصفية والمنشورات الأصلية، مع ضمان إحداثيات الموقع على الأقل الدقة على مستوى المقاطعة الولاية لبعض البلدان.
جمع بيانات حالات العدوى للفيروس
واستخدم التصور والتحليل المنفصل تصنيف الموقع إلى بلدان ومناطق وفقًا لقائمة NextStrain، مع مجموعات بيانات منسقة تم تجميعها في عينات فرعية للتخفيف من تحيز أخذ العينات.
بالنسبة للتحليلات التطورية، تمت محاذاة التسلسلات مع المحاذاة المتعددة باستخدام تحويل فورييه السريع (MAFFT) v.7.490، ثم تم قطعها باستخدام TrimAL v.1.، وتم تحديد القيم المتطرفة على مدار الساعة الجزيئية باستخدام TempEst v.1.5.3.
وقاموا بجمع بيانات عن جميع حالات العدوى البشرية المبلغ عنها والمؤكدة من منظمة الصحة العالمية وتفشي الطيور من قواعد البيانات العالمية للصحة الحيوانية.
